El Programa coordina acciones para que las entidades del nivel nacional mejoren el resultado del Índice de Transparencia.

El Índice Nacional mide el nivel de transparencia y los riesgos de corrupción de las entidades públicas del nivel central, elaborado y publicado por la ONG Transparencia Colombia. Evalúa Factores representativos de una institucionalidad íntegra así:

• Visibilidad
• Sanción
• Institucionalidad

Los resultados del índice implican que mayores niveles de transparencia significan menores riesgos de corrupción, y bajos niveles de transparencia, altos riesgos de corrupción.